Отдел внутреннего аудита МЗ оказывает содействие руководителям организаций здравоохранения, посредством проведения анализа, оценки и мониторинга адекватности и эффективности системы внутреннего контроля, надежности и достоверности финансовой и управленческой информации, результативности, экономичности и эффективности деятельности, сохранности активов и соблюдения законодательства Кыргызской Республики т.е. проводит оценку возможных финансовых и операционных рисков (мошенничества и хищения), по результатам оценки разрабатывает план действии по устранению рисков и усилению контроля финансово-хозяйственной деятельности.

В соответствии с утвержденными годовыми планами аудита за 2016-2017 годы и 1 квартал 2018 года проведены аудиты всего в 99 организациях здравоохранения. Также по результатам обращений Генеральной прокуратуры КР, ГСБЭП при ПКР, АКС ГКНБ КР и по заявлениям граждан КР проведены 67 специальных расследований, о результатам специальных расследований в 41 случаях указанные факты в обращении подтвердились,

Общая сумма выявленных финансовых нарушений за 2016-2017гг и 1 квартал 2018 года составила всего 145381400 (сто сорок пять миллионов триста восемьдесят одна тысяча четыреста) сом.

             По результатам аудита за 2016-2017гг. материалы 30-и организаций здравоохранения переданы в Генеральную прокуратуру КР и ГСБЭП при ПКР, для дальнейшего расследования. Общая сумма финансовых нарушений, переданных в правоохранительные органы составила всего 106716800 сом.

По результатам проведенных аудитов за 2016-2017гг. организациям здравоохранения были предоставлены всего 511 рекомендаций по улучшению системы внутреннего контроля и минимизации финансовых рисков. По представленным отчетам по состоянию на 1 апреля 2018 года организациями здравоохранения исполнено всего 447 рекомендаций, что составляет 87,4 %, не исполнено 64 рекомендаций. По не исполненным рекомендациям направлены уведомления. В результате исполнения вышеуказанных планов мероприятий, в проаудированных организациях здравоохранения устранены недостатки и усилены контроли в среде внутреннего контроля, а также предотвращены риски мошенничества и хищения.

В целях повышения потенциала и осведомленности руководителей организаций здравоохранения, отделом внутреннего аудита проведены тренинги по нормативно-правовым актам КР, для руководителей организации здравоохранения всех 7-ми областей и городов Бишкек и Ош.

Министерством здравоохранения КР совместно Международной аудиторской компанией ЗАО Грант Торнтон разработана автоматизированная программа аудита «Smart Audit», которая работает в режиме онлайн, что в свою очередь исключает риск человеческого фактора, данная программа разработана с поддержкой Немецкого Банка Реконструкции (KfW).